Năm 2006, ở đồng bằng Bắc Bộ mực nước bình quân tầng chứa nước thấp hơn so với năm trước, bị nhiễm Mn, As cao hơn chỉ tiêu cho phép ở một số mẫu đo
ở Nam Bộ: mực nước ngầm suy giảm
có nơi các kim loại có hàm lượng vượt quá chỉ tiêu cho phép
Tây Nguyên: mực nước cao hơn giá trị trung bình nhiều năm. ở Buôn Mê Thuột: mực nước giảm, tốc độ 0,2m/năm độ sâu. Độ khoáng hoá thay đổi không đáng kể. Có lỗ khoan Hg đạt 0,002mg/l (Đắc Lắc).