Thành phân loài khu hệ thú Tây Côn Lĩnh khá đa dạng, đã thống kê được 45 loài thuộc 22 họ, 8 bộ đặc trưng của tỉnh Hà Giang, trong số đó có 14 loài quý hiếm đã được xếp trong sách đỏ Việt Nam. Mật độ và trữ lượng thú Tây Con Lĩnh còn khá phong phú. Các loài quý hiếm phân bố khá tập trung ở phía Tây và Tây Nam trong các khu rừng già thuộc địa phận xã Lao Chải và Cao Bồ. Cần có kế hoạch nghiên cứu điều tra cơ bản tài nguyên thiên nhiên, bảo vệ rừng để có đủ cơ sở khoa học xây dựng khu bảo tồn thiên nhiên Tây Côn Lĩnh.