Chương trình KC 09 giai doạn 2000-2005 với 24 đề tài về điều tra cơ bản biển và ứng dụng công nghệ biển. Kết quả của chương trình gồm bộ cơ sở dữ liệu khổng lồ về biển, công nghệ biển, điều kiện tự nhiên môi trường biển, hải dương học nghề cá, hiện trạng xói lở bờ biển, bản đồ địa chất 1:1.000.000 Biển Đông, cơ sở dữ liệu về điều kiện tự nhiên và tài nguyên cho 48 vũng vịnh theo 5 tiêu chí: giao thông cảng, thuỷ sản, du lịch, bảo tồn tự nhiên, an ninh quốc phòng.br