Hoạt động khoa học công nghệ thuỷ sản giai đoạn 2001-2005 đạt trên 135 tỷ đồng với 328 đề tài, chủ yếu thộc lĩnh vực nuôi trồng thuỷ sản như nuôi tôm sú, nuôi tôm trên cát, nuôi cá giò, có song... Nhiều hoạt động khoa học trong nghiên cứu bảo vệ môi trường, khai thác, cơ khí dịch vụ hậu cần, chế biến bảo quản. Nêu một số hạn chế trong hoạt động khoa học ở một số địa phương.