Mục tiêu của chuyển dịch cơ cấu kinh tế hướng tới là thu nhập của các chủ thể kinh tê, của quốc gia không ngừng tăng lên. Muốn vậy, nhà nước phải có nhiều đòn bẩy có hiệu lực về kinh tế, trong đó sử dụng công cụ thuế có vai trò quan trọng trong mục tiêu chuyển dịch cơ cấu kinh tế theo hướng CNH-HĐH, được thể hiện trên nhiều lĩnh vực như: phục vụ định hướng chuyển dịch cơ cấu kinh tế hợp lý
bảo đảm nguồn thu không ngừng tăng lên của ngân sách nhà nước
phục vụ yêu cầu tài trợ cho chuyển dịch cơ cấu kinh tế
thuế góp phần phân bổ lại nguồn lực nhằm thực hiện tốt chương trình chuyển dịch cơ cấu kin h tế.