Những năm qua, bên cạnh đầu tư phát triển mạnh kinh tế - xã hội Đảng bộ tỉnh Phú Yên tập trung đẩy mạnh công tác xây dựng Đảng, nhất là triển khai thực hiện Nghị quyết Hội nghị Trung ương 4 khóa XII về tăng cường xây dựng, chỉnh đốn Đảng
ngăn chặn, đẩy lùi sự suy thoái tư tưởng chính trị, đạo đức, lối sống, những biểu hiện "tự diễn biến", "tự chuyển hóa" trong nội bộ gắn với việc thực hiện Chỉ thị số 05-CT/TW của Bộ Chính trị về đẩy mạnh học tập và làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh, tạo nên những chuyển biến tích cực và đạt được những kết quả quan trọng, góp phần xây dựng Đảng bộ ngày càng trong sạch, vững mạnh.