Thực hiện tốt các giải pháp thu thuế bảo vệ môi trường (TBVMT) nhằm tạo thêm nguồn thu, góp một phần chi đầu tư giải quyết các vấn đề về môi trường, đồng thời góp phần thay đổi nhận thức và hành vi của tổ chức, cá nhân trong việc giữ gìn môi trường, nâng cao nhận thức về bảo vệ môi trường trong cộng đồng là nhiệm vụ quan trọng của thanh tra thu ngân sách trong lĩnh vực môi trường. Nguồn thu từ TBVMT được đưa vào ngân sách Nhà nước như tất cả các khoản thuế khác. Từ nguồn ngân sách Nhà nước mới phân bổ theo các cấp từ Trung ương đến địa phương để chi vào các công việc như: đảm bảo an sinh xã hội, xây dựng kết cấu cơ sở hạ tầng... và trong đó có bảo vệ môi trường.