Cùng với việc nâng cao năng lực, hiệu quả và chất lượng kiểm toán của Kiểm toán nhà nước nói chung và tại các cuộc kiểm toán ngân sách, tiền và tài sản nhà nước của địa phương nói riêng, Đoàn kiểm toán đã chú trọng tổ chức kiểm toán chuyên sâu theo từng lĩnh vực, từng khâu trong quản lý, điều hành ngân sách và đã đạt được kết quả tích cực. Qua kiểm toán thu tại cơ quan thuế đã kiến nghị xử lý, khắc phục những hạn chế, sai phạm và kiến nghị tăng thu cho ngân sách nhà nước. Các kết quả phân tích này nhằm đưa ra một số gợi ý hữu ích đối việc tổ chức hoạt động kiểm toán thu ngân sách tại cơ quan thuế trong kiểm toán ngân sách, tiền và tài sản nhà nước của địa phương.