Đánh giá chung hiệu quả hoạt động KHCN giai đoạn 1996-2001 của Viện Nghiên cứu hạt nhân về các khía cạnh: kinh phí đầu tư, hiệu quả của các nội dung nghiên cứu, đào tạo cán bộ-chuyên gia, xây dựng tiềm lực cơ sở vật chất-kỹ thuật, kinh tế-xã hội, sử dụng các dự án viện trợ kỹ thuật để tăng cường năng lực nghiên cứu, hợp tác quốc tế, một số kiến nghị.