VNĐ99-3 là giống lúa được chọn lọc trực tiếp từ nguồn biến dị đột biến phóng xạ trên giống lúa Nàng Hương. Giống lúa đột biến VNĐ99-3 đã được cải thiện rõ rệt về dạng hình và đặc điểm sinh trưởng so với giống gốc: thời gian từ gieo đến chín khoảng 92-102 ngày
chiều cao đạt 92-100cm
dạng thân gọn, cứng, góc lá đòng thẳng, đẻ nhánh khá, bông to, nhiều hạt, trọng lượng 1000 hạt đạt 26-27g, năng suất thực tế đạt 5-7,5 tấn/ha trong điều kiện sản xuất ở vùng Đông Nam bộ. Giống có khả năng kháng rầy tốt
nhiễm đạo ôn trung bình
ít nhiễm vàng lá, đốm vằn
chống chịu tốt bệnh cháy bìa lá, lúa von. Chất lượng gạo, cơm của giống VNĐ99-3 đáp ứng tiêu dùng, chế biến hoặc xuất khẩu.