Môi trường đất, nước, không khí ở nông thôn chịu ô nhiễm do các hoạt động sản xuất của các làng nghề khác nhau. Nguồn gây ô nhiễm là nước thải, chất thải rắn không qua xử lý từ chế biến thực phẩm, tái chế chất thải, sản xuất vật liệu. Sức khoẻ người dân chịu tác động nghiêm trọng, nhiều căn bệnh phát triển. Các biện pháp đề ra là cần có quy hoạch các làng nghề, quản lý môi trường làng nghề, lựa chọn công nghệ sản xuất sạch hơn, thay thế các công nghệ cũ, lạc hậu.