Các đảo được khảo sát là Đá Tây, Tốc Tan, Sinh Tồn, Đá Nam, trong thời gian từ 2002-2003. Rạn san hô Trường Sa có 332 loài, 131 giống trong 44 họ. Chỉ số đa dạng sinh học từ 2,43-3,09. Cá thương phẩm có cá mú, cá song, cá hồng. Phân bố sinh thái rạn san hô liên quan tới độ phủ san hô, cấu trúc nền đáy và quan hệ cộng sinh của các loà i.