Giải quyết đơn đề nghị giám đốc thẩm, tái thẩm là loại việc rất phức tạp, đa số vụ, việc đã được cấp sơ thẩm, phúc thẩm giải quyết trước một cách kỹ càng, đến cấp giám đốc thẩm, tái thẩm thì chỉ khi phát hiện ra vi phạm nghiêm trọng hoặc xuất hiện tình tiết mới thì mới có căn cứ kháng nghị giám đốc thẩm, tái thẩm. Đây là thẩm quyền mới và cũng là thách thức lớn trong quá trình tiếp nhận, phân loại, thụ lý và giải quyết đơn đề nghị kháng nghị giám đốc thẩm, tái thẩm đối với Viện kiểm sát nhân dân cấp cao. Nếu không có giải pháp đúng đắn, kịp thời sẽ ảnh hưởng đến quyền và lợi ích của nhân dân.