Quản lý về biển đảo theo ngành, lĩnh vực trong điều kiện hệ thống chính sách, pháp luật về biển, đảo còn thiếu đồng bộ và chồng chéo là cho hiệu lực thi hành pháp luật yếu, tổ chức triển khai thiếu phối hợp giữa các ngành, các câp. Do đó, một trong những vấn đề cấp bách hiện nay là tăng cường thiết chế dân chủ để nhân dân tham gia cùng cơ quan quản lý nhà nước về biển và hải đảo thực thi pháp luật hiệu quả.