Phân vùng dịch tễ sốt rét và can thiệp (DTSR và CT) dựa vào các yếu tố về vùng địa lý, sinh cảnh, thảm thực vật rừng, khí hậu, chỉ số bệnh nhân sốt rét (SR), ký sinh trùng SR (KSTSR) và sự có mặt của muỗi truyền bệnh sốt rét... đã được thực hiện trên cả nước năm 2003. Phân vùng lần này nhằm xác định các vùng dịch tễ SR theo mức độ lưu hành khác nhau hiện nay và dân số nguy cơ của từng vùng, từ đó chỉ định các biện pháp can thiệp phòng chống vector, điều trị và quản lý ca bệnh thích hợp cho từng vùng. Kết quả phân vùng DTSR và CT hiện nay có 5 vùng. Bài viết nêu đặc điểm của từng vùng và từ các vùng SR trên, dân số cần được bảo vệ bằng các biện pháp PCSR là 37.154.286 người chiếm 46% dân số chung, nhưng trước mắt cần tập trung vào 3 vùng SR lưu hành nhẹ, vừa và nặng với dân số là 18.536.244 người.