Theo kết quả điều tra đến năm 2005, đã xác định được 854 loài thuộc 478 chi, 129 họ của 4 ngành thực vật bậc cao tại Vườn quốc gia Yok Đôn. Trong hệ thực vật, có nhiều loài có giá trị kinh tế cao, có giá trị bảo tồn quốc tế và quốc gia. Hệ động vật bao gồm 65 loài thú thuộc 25 họ, 11 bộ
khu hệ chim gồm 245 loài, trong đó có 18 loài ở các cấp bị đe dọa hoặc gần bị đe dọa trên toàn cầu. Trong Vườn quốc gia có 3 kiểu rừng chính là: rừng khộp, rừng nửa rụng lá và rừng thường xanh. Nêu một số biện pháp bảo tồn đa dạng sinh học Vườn quốc gia Yok Đôn: quy hoạch các khu vực ưu tiên cho công tác quản lý, bảo tồn
bồi dưỡng, nâng cao kiến thức về công tác bảo tồn cho cán bộ chủ chốt của Vườn
xây dựng kênh đối thoại với các cơ quan lập kế hoạch tại địa phương
cải thiện việc thực thi luật pháp và các quy chế hoạt động của Vườn liên quan đến săn bắn, khai thác gỗ và lâm sản ngoài gỗ
nâng cấp hệ thống trạm gác và cải thiện chế độ tuần tr a.