Vấn đề lý luận trong việc xác định cơ cấu công chức hành chính bao gồm nhận thức, căn cứ, phương pháp và các yếu tố tác động, ảnh hưởng đến việc xác định cơ cấu công chức trong các cơ quan hành chính nhà nước, từ đó tác giả đã tạo dựng sơ bộ khung lý thuyết về cơ cấu công chức làm cơ sở cho việc hoàn thiện các quy định của pháp luật về vấn đề này ở Việt Nam hiện nay.