Kết quả điều tra đã xác định được 334 loài thực vật, 243 chi, 96 họ và 59 bộ thuộc 4 ngành: Bryophyta, Polypodiophyta, Gymnospermatophyta và Angiospermatophyta ở Khu di tích Xẻo Quít, huyện Cao Lãnh, tỉnh Đồng Tháp. Các taxa thuộc ngành Angiospermatophyta là đa dạng nhất và chiếm ưu thế nhất với 321 loài, 232 chi, 85 họ, 51 bộ và 2 lớp. Các họ có số lượng loài nhiều nhất là: Poaceae, Fabaceae, Cyperaceae, Asteraceae, Nymphaeaceae, Rubiaceae, Araceae, Acanthaceaem, Euphorbiaceae, Malvaceae. Các chi đa dạng nhất gồm: Cyperus, Nymphaea, Ficus, Rosa, Hibiscus, Bambusa, Bougainvillea, Cassia, Kalanchoe, Mimosa. Hệ thực vật có 5 dạng thân chính: cây gỗ, cây thảo, cây bụi, dậy leo và dây kí sinh, trong đó dạng cây thảo chiếm ưu thế với 195 loài. Khu di tích Xẻo Quít có 4 loài thực vật có nguy cơ tuyệt chủng theo Sách Đỏ Việt Nam là Drynaria fortunei, Cycas revoluta, Oryza rufipogon và Elaeocarpus hygrophilus.