Có 1505 thuốc tân dược được sử dụng, với 365 hoạt chất tại bệnh viện Phú Nhuận trong giai đoạn 2012-2017. Thuốc có thành phần phối hợp chiếm 14,4 phần trăm số thuốc sử dụng. Paracetamol là hoạt chất thông dụng nhất với 42 thuốc dạng đơn chất và 15 thuốc có phối hợp. Thuốc sử dụng tại bệnh viện Phú Nhuận được sản xuất bởi 42 quốc gia khác nhau, trong đó các thuốc sản xuất bởi Việt Nam, ấn Độ, Pháp, Hàn Quốc và Đức có số lượng thuốc và chi phí dành cho thuốc có giá trị cách biệt so với các quốc gia còn lại.